Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms