Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clip3B9EHT4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms