Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms