Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trabd2bB1ATG9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trabd2bB1ATG9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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