Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint2A7XUX6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint2A7XUX6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms