Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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