Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms