Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl41A2AUC9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl41A2AUC9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms