Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc4a11A2AJN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc4a11A2AJN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms