Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lcn6A2AJB9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Lcn6A2AJB9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Lcn6A2AJB9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Lcn6A2AJB9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lcn6A2AJB9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms