Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem185aA2AF53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms