Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80eA0A0U1RP99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms