Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms