Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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