Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 9230112J17Rik-202ENSMUST00000217430 764 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mkrn3Q60764 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mkrn3Q60764 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mkrn3Q60764 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mkrn3Q60764 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mkrn3Q60764 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mkrn3Q60764 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mkrn3Q60764 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Mkrn3Q60764 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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