Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms