Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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