Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gga3Q8BMI3 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms