Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms