Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.2 ms