Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 4732419C18Rik-201ENSMUST00000181805 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm16023-201ENSMUST00000137752 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Nnt-202ENSMUST00000099149 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Esrrb-204ENSMUST00000116402 4300 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Serpina3j-201ENSMUST00000109957 2155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 9330158H04Rik-208ENSMUST00000161820 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm37366-201ENSMUST00000194487 2297 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm8087-201ENSMUST00000119091 567 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Anapc15-ps-202ENSMUST00000218771 399 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Mtmr6-201ENSMUST00000022563 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Mylpf-201ENSMUST00000032910 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4283 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Cd200-201ENSMUST00000023341 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Lmod2-201ENSMUST00000031694 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Slc25a30-201ENSMUST00000022580 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Pou2f1-201ENSMUST00000027850 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Cldn1-201ENSMUST00000023154 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Lypd5-201ENSMUST00000032683 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm27927-201ENSMUST00000183791 126 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sox12Q04890 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms