Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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