Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Treml4Q3LRV9 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Treml4Q3LRV9 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Treml4Q3LRV9 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Treml4Q3LRV9 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Treml4Q3LRV9 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Treml4Q3LRV9 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms