Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms