Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Csmd1Q923L3 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms