Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc73Q8CDM4 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms