Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim17Q7TPM3 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim17Q7TPM3 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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