Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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