Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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