Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rrn3B2RS91 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rrn3B2RS91 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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