Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms