Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms