Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms