Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Padi1Q9Z185 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Padi1Q9Z185 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Padi1Q9Z185 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Padi1Q9Z185 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Padi1Q9Z185 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Padi1Q9Z185 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms