Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms