Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms