Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gpc6Q9R087 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc6Q9R087 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gpc6Q9R087 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gpc6Q9R087 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc6Q9R087 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms