Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp11cQ9QZW0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp11cQ9QZW0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms