Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms