Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apbb1Q9QXJ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms