Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms