Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms