Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms