Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms