Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms