Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms