Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole3Q9JKP7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms