Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms