Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uchl3Q9JKB1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uchl3Q9JKB1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms