Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms